玩家在成功修复研究所后就可以在里面研究果树或者农作物了，每种果树和农作物都有三个研究路线。研究需要消耗试剂，这种试剂是在劳拉的商店里售卖，每天可以买三个半价的试剂。没有打折的试剂不会有购买次数限制，然而一瓶试剂就要一万金币，因此每天只提议买三个半价的。除了购买外，部分签到活动主题里会不收费送试剂，但主要还是靠买，而且要把一种农作物的三个路线都研究到满级要很多的试剂。更别说农作物和果树的种类加起来有几十种，一般到后期才会致力于把全部种类都研究到满级，前期只用研究一些收益高的作物或者果树就行。

一种果树的三个研究路线分别是减少成熟时刻、增加巨大化概率和增加双倍产出的概率。其中减少成熟时刻这一项只有成熟时刻在五分钟以上的农作物有，时刻较短的作物没必要研究这一项。在研究这个路线时优先选择成熟时刻最长的，比如有作物的成熟时刻长达八小时。增加巨大化概率这个路线只有想要参与锦标赛的玩家才用优先研究，而且研究的对象为锦标赛里常出现的几种农作物。另外如果玩家对某一项巨大农作物的需求较大也可以优先研究，这样在种植时可以得到更多的巨大作物。

另外研究所里提高的巨大概率可以和其他方式进行叠加，比如相关天赋和巨大药水。增加双倍产出的路线适合想要赚金币的玩家，研究后每次种植就能得到更多的作物或者水果。大量的作物和水果不管是用来提交订单、做菜还是直接卖掉都能得到很多的金币。第三个路线在把研究所升到三级后才能解开，而更新研究所需要大量的船运材料和金币，到了中后期才能升三级。